光伏集裝箱的水取決于天氣狀況，海運航程的長短，貨物包裝材料、集裝箱狀況以及貨物的敏感度等。真菌、霉菌、霉在相對濕度超過55%時會對貨物造成損壞。
光伏集裝箱里面有水主要可分以下幾種情況：貨物自帶、箱體凝結、海水入浸、淡水入浸。
1、貨物自帶
濕氣或水分隨貨物一起被帶入集裝箱。舉個例來說，如果一個集裝箱內裝了5噸的家具，家具本身就會含有大概8%到25%的濕度，根據木材類型、家具干燥處理程度的不同而有所不同。這相當于大約400-1250升的水。這里邊的濕氣有些就會散發到集裝箱內的空氣中，成為集裝箱水汽凝結的一個重要來源。
2、箱體凝結
在集裝箱遠洋運輸或存儲過程中，貨柜往往會經歷高溫氣候及較強的晝夜溫差變化，溫度變化會在0-8攝氏度，濕度會高達98%，這就是凝露現象，當溫度為30度時，空氣中水含量為30.4g每平方米。當溫度由30攝氏度降低到18攝氏度，水蒸氣就會凝結成水滴，若是40英尺貨柜則產生1000克的冷凝水，就會造成“集裝箱雨”。
3、海水入浸
常在海上漂，哪能不濕箱?如果遇到大風大浪，如果恰好箱體有小損傷，如果又在甲板上，或者遭遇海上事故，落入海里，那進海水或潮濕是沒跑的。這個不多說。
4、淡水入浸
箱子頂板或側板、前板、門板、門膠條等有破損的話，下雨雪時或船舶淡水管道破裂等都會導致進水。近期臺風密集，大江南北狂風暴雨，發貨時更要預防進水問題。
